A Esquadra 301 - Jaguares é herdeira da tradição das Esquadras equipadas com FIAT G91 que operaram na Força Aérea Portuguesa entre 1965 e 1993 e continuada durante os anos em que operou aeronaves Alpha Jet A até 2005.
      Durante o período da Guerra em África foram efectuadas mais de 13.000 saídas operacionais, tendo sido abatidas cinco aeronaves por mísseis AAA/SAM, com uma baixa mortal, sendo os restantes recuperados na área de combate.
      Em Agosto de 1974, no período pós-revolução, iniciou-se a transferência para a Base Aérea 6 no Montijo das aeronaves FIAT G91 oriundas da Base Aérea 5 bem como dos cenários ultramarinos. Assim se formou a Esquadra 62 - Jaguares que, desde logo, adopta o emblema actual, organizando-se em moldes NATO por forma a dar resposta aos compromissos assumidos no teatro Europeu.
      Com a reorganização das Unidades Aéreas, em 1978, recebeu a designação actual (Esquadra 301), cabendo-lhe como missão primária a execução de acções de Apoio Aéreo Próximo, Interdição do Campo de Batalha e Reconhecimento Aéreo Táctico e como missão secundária acções de Apoio Aéreo Táctico a Operações Marítimas e de Luta Aérea Defensiva.
      Os Jaguares têm participado em inúmeros exercícios no teatro europeu, entre os quais o "NATO Tiger Meet", estando presentes pela primeira vez em Kleine Brogel (Bélgica) em 1978 ainda como Esquadra 62 e sob estatuto de Esquadra convidada. Já recebeu por três vezes o trofeu "Silver Tiger" nos anos de 1980, 1985 e mais recentemente em 2011. Em 1987 os Jaguares organizaram e acolheram o evento pela primeira vez na BA6, Montijo.
      Por portaria de 19 de Abril de 1988, o Ministro da Defesa Nacional concedeu à Esquadra 301, nos termos do regulamento da Medalha Militar, a Medalha de Ouro de Serviços Distintos.
      Em 17 de Junho de 1993 assinalou-se a despedida da frota FIAT após mais de 75.000 Horas de voo, tendo o último voo oficial de FIAT G91 na Força Aérea Portuguesa ocorrido dez dias depois durante as comemorações do 41º aniversário da Força Aérea que decorreram no AM3 em Ovar. Com a desactivação desta aeronave e de acordo com a recente reestruturação da FAP, a Esquadra 301 foi transferida para a Base Aérea 11, em Beja tendo sido equipada com o avião de ataque ao solo, Alpha Jet A, realizando o primeiro voo no dia 6 de Outubro de 1993, sob o comando do Major Piloto-Aviador Lopes da Silva. Fruto dessa reestruturação, em 1995 a Esquadra voltou a assumir as missões para que estava designada e o seu papel no seio da NATO, de tal forma que, como membro distinto do Clube Tiger organizou em 1996, de forma excepcional, o "NATO Tiger Meet".
      Nos anos que se seguiram sucede-se uma vasta participação em exercícios da NATO, no âmbito da preparação da Esquadra como "Augmentation Force" para a área do Mediterrâneo. Neste contexto participou no "Dinamic Mix 97" (DM97) em Itália (Amendola), esteve também presente no "Strong Resolve 98", em duas frentes de operação, uma a partir de Beja e outra a partir de Ovar e ainda no "Dinamic Mix 98" na Turquia . Em 1999 participou no "Central Enterprise", que decorreu na Alemanha e ainda no "Polygonne", no mesmo país, tendo sido bastante elogiada pelo excelente trabalho desenvolvido, superando todas as expectativas.
      No ano 2000, atinge-se um marco importante para a frota Alpha Jet, o total de 25.000 Horas de voo (tendo para isso contribuído também a Esquadra 103). Para além disso continua a participação da Esquadra em vários Exercícios OTAN, proporcionando aos seus pilotos uma óptima ferramenta para aferir do seu desenvolvimento na condução das operações aéreas em teatros de operação cada vez mais elaborados constatando estes que caminham lado-a-lado com outras Unidades aéreas com missão semelhante. De destacar o "Linked Seas 2000", que decorreu em Portugal - Ovar, o "Dinamic Mix 2000" na Grécia - Araxos AB o "EOLO" que decorreu em Espanha, tendo a Esquadra operado a partir de Beja.
      Ao longo destes anos não se deverá deixar de referir que a Esquadra 301 é presença assídua em vários festivais Aéreos Internacionais, o que demonstra do seu prestígio e reconhecido valor no seio da Europa, mais concretamente no seio da OTAN. Em 2002, ano em que a Força Aérea Portuguesa comemorou o seu Cinquentenário, os Jaguares organizaram pela terceira vez na sua história o "NATO Tiger Meet".
      A 5 de Setembro de 2005, durante a realização de um exercício conjunto (COMAO - Composite Air Operations), a Esquadra 301 - Jaguares alcançou as 20.000 Horas de Voo com a frota Alpha Jet, um marco de grande significado na sua história. Seria já após as comemorações deste feito que, a 20 de Novembro de 2005, os Jaguares efectuam o último voo operacional com o avião Alpha Jet.
      Mais tarde, a 25 de Novembro, ocorre a transferência da Esquadra 301 para a Base Aérea 5 em Monte Real, significando uma vez mais o fim de uma Era cheia de história e tradição e o início de uma outra repleta de novos desafios.
      Os Jaguares formam então a primeira Esquadra de Voo da Força Aérea Portuguesa a operar exclusivamente aeronaves F-16 MLU. Dispondo de tecnologia avançada e ao nível das melhores do mundo, executa missões no âmbito da Defesa Aérea e de Ataque Convencional em quaisquer condições de tempo e de luminosidade.
      Desde cedo assumem um papel de destaque através da participação em exercícios e missões Nacionais e Internacionais de onde se destacam o "Real Thaw", o policiamento aéreo dos Países do Báltico - "Baltics Air Policing 2007" e o "NATO Tiger Meet", tendo reconquistado o Troféu "Silver Tiger" logo na sua segunda participação em pleno da Era MLU, em 2011, durante o 50º Aniversário destes encontros realizado em Cambrai, França.
      Composta inicialmente pelo núcleo de pilotos MLU, oriundos da Esquadra 201 - Falcões, o que permitiu alcançar desde muito cedo um elevado grau de proficiência, a Esquadra 301 e os Jaguares continuam fortemente empenhados a honrar e a demonstrar com o mesmo orgulho, tradição e espírito de sempre, o lema: